Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGDCC3Q8IVU1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms