Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC9A9Q8IVB4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A9Q8IVB4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms