Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LHFPL3Q86UP9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHFPL3Q86UP9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms