Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB1Q86U70 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB1Q86U70 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms