Protein–RNA interactions for Protein: Q86U38

NOP9, Nucleolar protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP9Q86U38 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOP9Q86U38 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP9Q86U38 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP9Q86U38 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms