Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4DQ86TL0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms