Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG4Q86SJ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG4Q86SJ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms