Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM2Q86SE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms