Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE3BQ7Z3V4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms