Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX6Q7RTT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms