Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP9Q7RTR0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms