Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYDE1Q6ZW31 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms