Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN12Q6ZSI9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms