Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC73Q6ZRK6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms