Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPOCD1Q6ZMY3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms