Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYHR1Q6ZMK1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms