Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms