Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3EQ6PEY2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms