Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF549Q6P9A3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF549Q6P9A3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms