Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C22orf39Q6P5X5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms