Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN13Q6MZZ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms