Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL2Q6ISB3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRHL2Q6ISB3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRHL2Q6ISB3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms