Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPPQ6IPU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms