Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC102BQ68D86 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102BQ68D86 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102BQ68D86 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms