Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SPATA1Q5VX52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA1Q5VX52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms