Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRCH2Q5VUJ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms