Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms