Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM69BQ5VUD6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM69BQ5VUD6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms