Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRTP1Q5TC63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms