Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPDC1Q5TB30 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms