Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F0

DCAF12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF12Q5T6F0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF12Q5T6F0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF12Q5T6F0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms