Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SWT1Q5T5J6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWT1Q5T5J6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms