Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF678Q5SXM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF678Q5SXM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms