Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms