Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CEP78Q5JTW2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP78Q5JTW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP78Q5JTW2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP78Q5JTW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms