Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB41Q5JT25 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms