Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1JQ5JR12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1JQ5JR12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1JQ5JR12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1JQ5JR12 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1JQ5JR12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1JQ5JR12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms