Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNDC3AQ59EK9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3AQ59EK9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms