Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSD17B12Q53GQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms