Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A12Q504Y0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A12Q504Y0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms