Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPRNQ4KMQ1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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