Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN20Q4JDL3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms