Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT71Q3SY84 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms