Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms