Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD55Q3KP44 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms