Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL40Q2TBA0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms