Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VMACQ2NL98 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms