Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM1Q2NKQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM1Q2NKQ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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