Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTC1Q2NKJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms