Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF2Q1L5Z9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF2Q1L5Z9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF2Q1L5Z9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LONRF2Q1L5Z9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms